西南财经大学供应链管理专业的历史可追溯至2004年设立的物流管理专业。为响应提升我国产业链和供应链现代化水平的重大战略需求，于2019年向教育部申请设立供应链管理专业，于2020年获批，同年正式面向全国招生。这是中西部地区双一流大学中最早开设的供应链管理本科专业。同时，原物流管理专业调整为与美国特拉华大学合作办学，目前该专业已成为国家一流本科专业建设点。供应链管理专业是教育部高等学校物流管理与工程类专业教学指导委员会首批新文科建设试点专业，供应链管理系也是教育部首批虚拟教研室的共建成员单位。
供应链管理系在资源建设方面成效显著，积极推动教学模式的转型，先后承担多项重大教学改革项目，包括国家级项目“《运作管理》信息技术改造”、中国物流协会的“项目教学法在物流教学中的应用”以及校内的实验示范课和双语课程等。本专业开设的五门课程荣获四川省精品课程、思政示范课程及一流本科课程等荣誉，并获得四川省高等教育教学成果奖两项。西南财经大学担任全国智慧物流与供应链行业产教融合共同体副理事长单位，同时拥有物流省级实验教学示范中心。本专业学生在各类竞赛中表现优异，先后获得国家级和省级优秀班集体等荣誉30余项。在大学生物流设计大赛、供应链大赛等全国性赛事中，多次荣获一、二等奖。